Je organ upravljanja šole katerega pristojnosti so opredeljene v 48. členu ZOFVI-ja in 1. členu Zakona o spremembah in dopolnitvah ZOFVI-ja (Ul. št. 58/2009). Mandat članov sveta zavoda traja štiri leta.
Svet zavoda je na redni seji, ki je potekala 7. 11. 2024, potrdil mandate članom Sveta zavoda Osnovne šole Vide Pregarc v sestavi:
- pet predstavnikov zaposlenih: Jera Csipö, Denis Kantarević, Petra Matkovič, Maja Tratar, Maja Vuga;
- trije predstavniki staršev: Tadej Krebs, Danijela Makovec Radovan, Manja Rančigaj Gajšek;
- trije predstavniki ustanovitelja: Ana Vehar, Cvetka Frece, Emina Halibašić.
Predsednica Sveta šole je Cvetka Frece, namestnica je Petra Matkovič.